Nemocnice Yadong uzavřela spolupráci s Microsoftem na Taiwan (MSFT-US) a společností Asia Genomics Technology (ATGENOMIX) s cílem vybudovat cloudový systém pro sekvenování genů. Tento projekt využívá platformu Microsoft Azure v Tchaj-wanu a má za cíl vytvořit „trvalou platformu pro přesnou medicínu“ pro urychlení pokroku v oblasti personalizované medicíny a klinického výzkumu. Nemocnice Yadong se tak stala prvním na Tchaj-wanu, kdo implementoval jádrový systém sekvenování genů do cloudu jako první úroveň zdravotní péče.
Generální ředitel společnosti Microsoft Taiwan, Pan Chih-Hsiang, uvedl, že nemocnice Yadong umístila svá data o analýze sekvenování genů do cloudového prostředí Azure na Tchaj-wanu. Tento projekt představuje nejen první příklad pro úrovně zdravotní péče, ale i v Asii, kde je provedeno sekvenování genů u pacientů s rakovinou a vzácnými genetickými onemocněními v cloudu Azure. Díky cloudové architektuře, která je v souladu s místními předpisy a nabízí nízkou latenci a flexibilní rozšíření výpočetní kapacity, lze převést rozsáhlá data o sekvenování genů na okamžité poznatky.
Podle informací od Microsoftu systém využívá zdroje Azure v Tchaj-wanu a je schopen urychlit analýzu dat o sekvenování genů díky flexibilnímu rozšiřování výpočetní kapacity a automatizovaným mechanismům, vše v bezpečném, regulovaném a cloudovém prostředí s nízkou latencí. To pomůže nemocnicím postupně zlepšit identifikaci a správu zdraví u populačních skupin s vysokým rizikem genetických mutací. Systém by měl poskytnout klinické reference v různých fázích zdraví, subzdraví až po onemocnění, což podpoří včasné varování a intervence ke snížení rizik onemocnění.
Aby nemocnice Yadong zlepšila efektivitu analýzy a flexibilitu aplikací, spolupracovala s ATGENOMIX a využila jejich cloudovou platformu Bio-IT Atgenomix Seqslab k vývoji vlastního cloudového systému pro sekvenování genů. Tato struktura, postavená na platformě Microsoft Azure, kombinuje flexibilní rozšíření výpočetní kapacity a automatizované procesy, což umožňuje rychlé zpracování velkého množství genetických dat a urychluje realizaci personalizované medicíny a klinického výzkumu.
Nemocnice Yadong také buduje a pravidelně aktualizuje svůj genový datový sklad s cílem shromáždit a analyzovat genetická data. Každé čtvrtletí nebo půl roku mohou být nahrána sekvenční data stovek pacientů a bezpečně uložena v Azure Data Lake. Každý pacient má přibližně 700 tisíc mutací genů, což představuje podstatné množství dat, které tvoří základ pro další analýzu nebo výzkum.
Vzhledem k rostoucímu objemu dat a nutnosti zvýšit efektivitu analýzy systém dále integruje GPU akcelerovaný balík pro analýzu genomu NVIDIA Parabricks, který zlepšuje výkon zpracování a drasticky zkracuje čas potřebný pro analýzu z původních čtyř hodin na pouhých deset minut. A pokud jde o velké zpracování dat, jako je joint analysis pro celogenomové profily (WGG) z 2500 pacientů, dokáže se to dokončit do 40 hodin, což představuje zlepšení efektivity až 16krát.
Generální ředitel ATGENOMIX, Zhang Mingtai, poznamenal, že díky cloudové platformě Microsoft Azure lze uspokojit velké a rychlé výpočetní a úložné požadavky, což skutečně umožňuje implementaci přesné medicíny v klinické praxi.
